Мониторинг распространения геновариантов SARS-CoV-2 в Свердловской, Челябинской областях и Пермском крае

Аннотация:

Исследование геномного разнообразия SARS-CoV-2 проведено во время снятия коронавирусных ограничений и открытия государственных границ России с другими странами. Цель исследования. Выявление геновариантов SARS-CoV-2 на территориях Свердловской, Челябинской областей и Пермского края. Материал и методы. Методом секвенирования по Сэнгеру исследовано 1127 носоглоточных мазков больных новой кopoнавирусной инфекцией, находящихся на лечении в Свердловской, Челябинской областях и Пермском крае. Результаты. B работе продемонстрирована динамика появления штаммов нового короновируса и нескольких мутаций за период с мая по декабрь 2022 r., проведена описательная статистика. B период проведения исследования наблюдалось превалирование варианта Omicron (~97%), содержащего по сравнению с вариантами Delta и Alpha больщее количество мутаций, приводящих к замене аминокислот. Субвариант Omicron BA.2 преобладал в период исследования с мая по сентябрь, затем с октября по декабрь 2022 г., субварианты BA.4/BA.5 вытеснили BA.2. Заключение. Анализ молекулярного состава вариантов SARS-CoV-2 показал присутствие нетипичных мутаций в некоторых образцах (E484K,G485R, R408l ), а также увеличение в числе мутаций у вариантов, в особенности в рецепторсвязывающем домене RBD. По данным литературы, аминокислотные замены приводят к изменению конформации S-белка, что, в свою очередь, повышает аффинность связывания RBD с ACE2 и влияет на более легкое течение заболевания и высокую контагиозность по сравнению с ранними вариантами SARS-CoV-2.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2023
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2023.-N 4.-С.15-20. Библ. 19 назв.
Просмотров: 8