Исторические изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья, их вирусологическая характеризация, полногеномные последовательности и филогения

Аннотация:

Введение. Цель исследования состояла в исследовании изолятов альфавирусов, изолированных в Уганде и Танзании в период, предшествующий их глобальному распространению и относяшихся к середине прошлого века. Мы предполагали, что анализ их геномов позволит уточнить особенности и направленность молекулярной эволюции альфавирусов в современных условиях. Материал и методы. Архивные образцы вирусов чикунгунья (CHIKV) и леса Семлики (SFV) были восстановлены культивированием на клетках Vero E6. Изоляты идентифицировались методом OT-?UP с последующим секвенированием. Полногеномные последовательности определяли NGS-секвенированием и использовали для филогенетического анализа. Результаты и обсуждение. Идентифицировано наличие в исследуемом архивном образце CHIKV двух представителей рода Alphavirus, а именно CHIKV и SFV. B архивном образие 1942 г. был обнаружен только SFV. Bce изоляты оказались способны высокоэффективно реплицироваться на клеточных культурах C6/36, Vero E6, 293 и СПЭВ с развитием цитопато-генного действия и вызывать патоморфологические изменения у мышей, характерные для этих альфавирусов. Определены их полногеномные последовательности и проведен их анализ. Выделенные изоляты кластеризуются с типичными африканскими штаммами CHIKV и SFV. Эти изоляты могут быть отнесены к старейшим известным штаммам SFV и CHIKV, датируемыми 1942 и 1953 годами, сохранившимися в лабораторных коллекциях. Архивный изолят CHIKV генотипируется как ECSA-вариант, с современными представителями которого ассоциируется глобальное распространение CHIKV и возникновение крупных вспышек лихорадки чикунгунья в последние десятилетия. Заключение. Изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья восстановлены из архивных лабораторных образцов, предположительно датируемых 1942 и 1953 годами, проведена их вирусологическая характеризация, генотипирование и анализ их полногеномных последовательностей. Ключевые слова: альфавирусы, вирус чикунгунья, вирус леса Семлики, геномные последовательности, филогения.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2023
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2023.-N 4.-С.38-44. Библ. 29 назв.
Просмотров: 7