ЭВОЛЮЦИЯ ВИРУСА SARS-COV-2 В ПРИМОРСКОМ КРАЕ В 2020-2023 гг.

Аннотация:

Возникшее в конце 2019 г. в китайской провинции Хубэй и распространившееся затем по всем странам новое коронавирусное заболевание - COVID-19 - этиологически связанное с SARS-CoV-2 (Nidovirales: Coronaviridae, Betacoronavirus, подрод Sarbecovirus), стала первой в истории человечества документированной пандемией, вызванной коронавирусом (хотя опасные эпидемические вспышки и эпидемии, связанные с коронавирусами, уже регистрировались в начале XXI века. SARS-CoV-2 является природно-очаговым вирусом, естественным резервуаром которого являются летучие мыши (Chiroptera, Microchiroptera). Использовав панголинов в качестве промежуточных хозяев, SARS-CoV-2 преодолел межвидовой барьер, вырвался «на эпидемический простор» и положил начало полномасштабной пандемии. Хотя, на сегодняшний день, ВОЗ официально объявила о завершении пандемии, SARS-CoV-2 продолжает циркулировать в человеческой популяции и продолжает эволюционировать, что повышает риск возникновения новых вариантов и новых эпидемических подъёмов заболеваемости. Благодаря молекулярно-генетическому мониторингу были выявлены генетические варианты SARS-CoV-2, которые циркулировали в различных регионах РФ во время пандемии. Однако информация о характеристиках эпидемического процесса COVID-19 и генетическом разнообразии вариантов SARS-CoV-2 в Приморском крае остается ограниченной. Нами было проведено полногеномное секвенирование 302 образцов назофарингеальных смывов, предоставленных Центром молекулярной диагностики НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора. Секвенирование проводилось при помощи нанопоровой технологии на приборе MinlON (Oxford Nanopore Technologies, Великобритания). В анализ были также включены 502 полногеномные последовательности образцов SARS-CoV-2, полученные в Приморском крае за указанный период и загруженные в базу данных VGARus другими учреждениями Роспотребнадзора и Минздрава.

Авторы:

Издание: Дальневосточный журнал инфекционной патологии
Год издания: 2023
Объем: 2с.
Дополнительная информация: 2023.-N 45.-С.115-116. Библ. 20 назв.
Просмотров: 11