ОСОБЕННОСТИ ПОДБОРА ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА

Аннотация:

Клещевой энцефалит (КЭ), этиологически связанный с вирусом клещевого энцефалита (ВКЭ) (Amariliovirales: Flaviviridae, Flavivirus) - тяжелая природно-очаговая вирусная инфекция, передающаяся трансмиссивным путем при укусе иксодовых клещей (Parasitiformes: Ixodidae) и алиментарным путем при употреблении зараженных пищевых продуктов; основной пик заболеваемости КЭ приходится на весенне-летний период. ВКЭ широко встречается на территории Евразии от Атлантического до Тихого океана в лесных, лесостепных и экстразональных экосистемах. Ареал вируса, в основном, совпадает с ареалами его основных переносчиков - иксодовых клещей Ixodes persulcatus и I. ricinus. ВКЭ представляет собой икосаэдрический капсид, окружённый сферической липопротеиновой оболочкой (45-60 нм). Капсид включает односегментную РНК положительной полярности. Основными структурными белками вириона являются С, Е, М, кодируемые последовательностями на 5'-конце генома. На З'-конце расположены неструктурные белки NS1-NS5, заканчивающиеся стоп-кодоном UAA. Для структурных белков (и, соответственно - для 5'-конца генома) характерна высокая вариабельность, что определяет фенотипические и генотипические свойства генома ВКЭ. Цель исследования - осуществить подбор видоспецифичных праймеров для секвенирования полного генома дальневосточных штаммов ВКЭ.

Авторы:

Издание: Дальневосточный журнал инфекционной патологии
Год издания: 2023
Объем: 2с.
Дополнительная информация: 2023.-N 45.-С.127-128. Библ. 12 назв.
Просмотров: 12