Подавление протеомной активности, связанной с пациентами с COVID-19, страдающими астмой, на основе паттерна экспрессии генов

Аннотация:

Введение. Инфекция SARS-CoV-2 была связана с различными хроническими и иммунозависимыми заболеваниями, включая астму. Цель исследования — оценка экспрессии генов у пациентов с COVID-19 с астмой или без нее. Материалы и методы. 20 профилей пациентов из 288 были выбраны из Gene Expression Omnibus (GSE178399). Bce пациенты имели положительные ПЦР-тесты и были разделены на 4 группы. GEO2R использовался для оценки сравнения между группами. Инструмент STRING применялся для измерения корреляции между генами. Филогенетическое дерево было извлечено с использованием iTOL. Тепловая карта была построена с помощью iDEP.96. Результаты. MMP10 (матриксная металлопротеиназа-10), TNFRSF11B (представитель суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли 11B), CCL23 (лиганд 23 хемокина мотива CC), CD274 (запрограммированная гибель клеток 1), C?3CL1 (хемокин мотива С-ХЗ-С) и IL17C (интерлейкин-17С) подавлял активность у всех пациентов. Данные транскриптома не выявили корреляции между экспрессией MMP10 и астмой, хотя существует значительная корреляция между экспрессией MMP1 и чувствительностью. Экспрессия IL17A, тесно связанная с аллергической астмой, снижена у лиц, не страдающих астмой, но повышена у больных астмой, особенно у выживших. У пациентов, не страдающих астмой, уровни CXCL9 были значительно выше. Выводы. Исследование выявило несоответствие во взаимосвязи между несбалансированной экспрессией генов в исследованных группах. Экспрессия генов у выживших и умерших пациентов с астмой существенно не различалась.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2024
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2024.-N 1.-С.133-142. Библ. 24 назв.
Просмотров: 8