Молекулярно-генетический анализ штаммов Vibrio cholerae O1 Эль-Тор, выявленных на территории России в 2023 г.

Аннотация:

Цель исследования. Сравнительный анализ генома нетоксигенного и токсигенных штаммов V. cholerae O1 Эль Тор, выявленных на территории России в 2023 r., и их филогенетический анализ. Материал и методы. Использовали штаммы V. cholerae O1 Эль Тор, выделенные на территории России в 2023 г. от больных и из водной среды. Анализ их геномов, секвенированных нами, выполняли с помощью программ UCENE v.45.1 и Bandage v.0.8.1. Для проведения SNP-анализа использовали нуклеотидные последовательности полных геномов 63 штаммов V. cholerae Эль Тор, полученных нами (41 штамм) и взятых из базы данных NCBI GenBank (22 штамма). Для оценки фенотипических свойств штаммов (чувствительность к антибиотикам, продукция гемолизина и протеазы, подвижность) применяли общепринятые методы. Результаты. Анализ секвенированных полных геномов штаммов V. cholerae Эль Тор, изолированных от больных и из водной среды в 2023 г. на территории России, показал их генетическое разнообразие. Токсигенные штаммы относились к различным типам геновариантов, имеюших разные мутации в геноме мобильных элементов, а также в коровых генах, связанных с патогенностью, способностью к эпидемическому распространению и лекарственной устойчивостью. Клинический штамм M3208 имел полный набор измененных генов вирулентности (ctxB7, tcpAc"ls'01, rt?A4} и эпидемичности (VSP-IIa), характерных для широко распространенных в период 3-й волны пандемии новых вариантов с высоким патогенным потенциалом. Кроме того, возникшие мутации привели к появлению устойчивости к налидиксовой кислоте (Nal,) и утрате резистентности к полимиксину B (Pols). Второй токсигенный штамм M3210, изолированный из речной воды, по составу мутантных генов отличался от штамма M3208, поскольку имел лишь один измененный ген (ctxB). Генотип этого штамма полностью соответствовал таковому ранее возникших геновариантов из 2-й волны пандемии с более низким уровнем вирулентности, которые сохранились лишь в ряде эндемичных регионов. B отличие от них нетоксигенный изо-лят M3209, выделенный от больного OK3, был лишен не только профага CTX?, но и других мобильных элементов с ключевыми генами патогенности и эпидемичности. B его геноме присутствовал лишь делетированный остров пандемичности VPI-2. Показана продукция этим штаммом дополнительных факторов патогенности (гемолизина, растворимой гемагглю-тинин/протеазы, подвижность), которые могли обусловить у зараженных развитие гастроэнтерита. Заключение. Выявлено геномное разнообразие штаммов V. cholerae Эль Тор, занесенных в Россию в 2023 г. Установлено, что токсигенные штаммы являются различными геновариантам с измененными эпидемически важными свойствами. Среди них клинический токсигенный штамм M3208 по набору мутантных генов относился к новым геновариантам с высоким патогенным потенциалом.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2024
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2024.-N 1.-С.34-42. Библ. 26 назв.
Просмотров: 8