Частные и общие ограничения в кодировании генов и синонимическое рекодирование их

Аннотация:

Актуальность. B интенсивно развивающейся синтетической биологии синонимическое рекодирование генов является ведущим методом, не лишенным неудач при его использовании. Цель исследования. Выявить природные ограничения в использовании кодонов в генах. Материал и методы. Компьютерным анализом в 30 генах вирусов, бактерий, архей и человека исследовали нуклеотидный состав, трансляционный код кодируемых ими белков, состав динуклеотидов, дикодонов и трикодонов. Для выявления ограничений в кодировании генов использованы последовательности количественных показателей кодонов (индексов компле-ментарности (ИК) и индексов размерности). Результаты. У каждого гена были выявлены ограничения (частные) по нуклеотидному составу, трансляционному коду, составу динуклеотидов и дикодонов. Обшим ограничением в кодировании генов является то, что разнииа ИК соседствующих трикодонов, считанных со сдвигом рамки на один кодон, как это происходит при трансляции мРНК на рибосомах, в подавляющем числе трикодонов составлляла не более 2. Заключение. Поскольку в генах каждый кодон, за исключением первых и последних трех кодонов, включается в три последовательно считаваемые трикодоны, то ИК каждого кодона связан с ИК двух предшествующих и двух последующих кодонов. Это подводит к признанию существования в генах континуума связности кодонов по значениям их ИК.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2024
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2024.-N 1.-С.43-49. Библ. 7 назв.
Просмотров: 9