Дальневосточный государственный медицинский университет Поиск | Личный кабинет | Авторизация
Поиск статьи по названию
Поиск книги по названию
Каталог рубрик
в коллекциюДобавить в коллекцию

Мультилокусные HLA-гаплотипы (A-B-C-DRB1-DRB3/DRB4/ DRB5-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1) в семьях больных с назначением к трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток


Аннотация:

HLA-гаплотип — совокупность HLA-генов, лежащих на одной хромосоме. Высокополиморфные HLA-гены демонстрируют выраженное неравновесное сцепление между собой, что приводит к формированию мультилокусных HLA-гаплотипов. Оценка разнообразия HLA-гаплотипов в популяции важна при трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Золотым стандартом для изучения HLA-гаплотипов являются семейные исследования. HLA-гаплотипы, полученные на основе наблюдений за сегрегацией HLA-аллелей в пределах семьи, реально существуют в человеческой популяции. Цель работы — установление частот HLA-A-B-C-DRB1-DRB3/DRB4/ DRB5-DQA1-DQB1-DPA1-DPB1-гаплотипов в семьях больных с назначением к HLA-типированию для проведения трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Исследование включало 109 семей больных с заболеваниями системы крови, в которых больным и членам их семей было назначено HLA-типирование для поиска донора аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Больные и члены семей были типированы методом NGS в лаборатории тканевого типирования ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России по HLA-генам — А, В, С, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQA1, DQB1, DPA1 и DPB1 методом секвенирования следующего поколения с помощью AllType FastPlex NGS Amplification Kits (One Lambda, США). Полученные последовательности анализировались при помощи компьютерной программы TypeStream Visual Software (TSV) и базы данных IPD-IMGT/HLA 3.44. B исследованных семьях было установлено 360 копий HLA-гаплотипов. Частоты HLA-гаплотипов определялись прямым подсчетом. Наиболее распространенным 7-локусным гаплотипом являлся A*01:01-B*08:01-C*07:01-DRBl*03:01-DRB3*01:01-DQAl*05:01-DQBl*02:01/163N, наиболее распространенным 9-локусным гаплотипом — A*03:01-B*07:02-*07:02-DRBl*15:01-DRB5*01:01-DQAl*01:02-DQBl*06:02-DPAl*01:03-DPBl*04:01P. Эти HLA-гаплотипы в варианте A-B-C-DRBl-DQBl являются первым и вторым по распространенности HLA-гаплотипами в большинстве российских регистров доноров костного мозга. Несмотря на некоторые отличия, распределение HLA-гаплотипов в семьях больных и в российских регистрах обладает схожестью, поэтому вероятность найти совместимого донора для больных с распространенными HLA-гаплотипами в российских регистрахдостаточно велика. Полученные знания о реальных 7- и 9-локусных HLA-гаплотипах, существующих в семьях больных с назначением к трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток, могут быть использованы в клинической практике в качестве референсных для анализа результатов HLA-типирования и предсказания ожидаемых HLA-гаплотипов. Показано, что, несмотря на существование горячей точки рекомбинации между локусом HLA-DP и остальным комплексом HLA-генов, наблюдается сильное неравновесное сцепление между некоторыми аллелями генов DRBl и DPBl.

Авторы:

Хамаганова Е.Г.
Хижинский С.П.
Абдрахимова А.Р.
Кузьминова Е.П.
Леонов Е.А.
Покровская О.С.
Кузьмина Л.А.
Паровичникова Е.Н.

Издание: Медицинская иммунология
Год издания: 2024
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2024.-N 2.-С.291-302. Библ. 35 назв.
Просмотров: 8

Рубрики
Ключевые слова
«нмиц
am
dr
fas
hla-dp
hla-гаплотип
hla-типирование
hla
kit
ts
аллеля
аллогенная
анализ
базы
больные
больными
большая
бытовые
вариантные
вероятности
второй
высокий
гаплотип
гаплотипы
гематология
гемопоэтические
генетический
генов
горячей
данные
днк
донор
заболевания
знание
золота
изучение
иммунитет
использованием
исследование
исследования
качества
клетки
клеток
клиническая
ключ
комплекс
компьютерная
копия
костная
кроветворных
крови
лаборатории
лежащий
локус
метод
минздрав
мозга
наблюдение
назначение
неравновесное
одного
ожидаемая
основа
отличия
оценка
первая
подсчет
поиск
поколений
пола
полиморфизм
помощи
популяции
последовательностей
практика
проведение
программ
прямая
работа
распределение
распространенность
распространенный
регистр
результата
рекомбинация
россии
российская
сегрегация
секвенирование
семей
семейная
семьи
силлард
систем
след
слова
совокупность
стандартам
стволовые
стволовых
сцепление
сша
типирование
тканевая
точка
трансплантации
трансплантация
формирование
хромосома
хромосомы
цель
частота
человеческая
члена
Ваш уровень доступа: Посетитель (IP-адрес: 18.97.9.174)
Яндекс.Метрика