Полиморфизм генов рецепторов терминации спор у штаммов Bacillus anthracis основных генетических линий

Аннотация:

Генетическая структура глобальной популяции Bacillus anthracis характеризуется неравной распространённостью изолятов основных генетических линий А, В и С, причина которой не установлена. Актуально определение особенностей генов, кодирующих факторы, определяющие существование этого патогена на внутри- и внеорганизменной стадиях жизненного цикла, которые могут влиять на распространённость штаммов. Цель работы — характеристика генов и белков терминации спор у штаммов В. anthracis разных генетических линий. Материалы и методы. Изучены полногеномные последовательности 46 штаммов В. anthracis и штамма CI В. cereus biovar anthracis из базы данных GenBank NCBI. Анализ in silico проводили в программах «BLASTn», «MEGAX», «Tandem Repeat Finder». Результаты. Количество однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), инделов и псевдогенов у штаммов В. anthracis линии В было больше в 2,7-25,6 раза, линии С — в 2,0-3,5 раза, а у штамма В. cereus biovar anthracis — в 20-2841 раз, чем у штаммов линии А. Значимые замены в генах, приводящие к изменению аминокислотного состава 10 белков рецепторов терминации, также значительно чаще встречались у штаммов В. anthracis линий В, С и штамма В. cereus biovar anthracis. Идентифицированы неописанные VNTR в пределах гена дегНА с единицей повтора 78 и 117 п.н. и SNP в гене дегМ, варьирующие между и внутри изолятов разных генетических линий. Показано, что 6 генов рецепторов герминации имеют редкие стартовые кодоны. Заключение. Большее количество несинонимичных SNP в генах рецепторов терминации спор с изменением аминокислотного состава и, вероятно, функции белков у штаммов В. anthracis основных генетических линий В, С и В. cereus biovar anthracis, чем у штаммов линии А, может определять их ограниченные адаптационные возможности и быть одним из объяснений меньшей распространённости по сравнению с линией А. Различия в генах дегНА и дегМ позволяют дифференцировать основные генетические линии В и С от А.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2024
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2024.-N 2.-С.237-247. Библ. 21 назв.
Просмотров: 6