Микробиота желудка у пациентов с диспепсией: метатранскриптомный анализ

Аннотация:

Цель исследования: оценить состав микробиоты слизистой оболочки тела и антрального отдела желудка. В исследование были включены 60 пациентов с симптомами диспепсии. Проанализировано по два образца слизистой оболочки желудка каждого пациента — из тела и антрального отдела. В полученных биоптатах определяли наличие инфекции Н. pylori методом ПЦР, проводили выделение РНК и подготовку библиотек для метатранскриптомного анализа гена 16S рРНК. Секвенирование осуществляли на приборе MiSeq (Illumina, США) с использованием набора реагентов MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle) (Illumina, США). В результате в группе Н. pylori-положительных пациентов выявлено снижение видового разнообразия на фоне преобладания бактерий вида Helicobacter pylori, что было подтверждено с помощью индекса Шеннона, среднее значение которого составило 3,6 в группе Н. руlоri-положительных и 5,4 в группе Н. pyloriотрицательных пациентов. В случае отсутствия Н. pylori наблюдали увеличение представленности бактерий родов Streptococcus, Prevotella и Alloprevotella. Уровень обсемененности Н. pylori слизистой оболочки желудка варьирует в антральном отделе и теле желудка, в отдельных случаях достигая разницы в 3,5 раза. При сравнении представленности других бактерий в теле и антральном отделе желудка статистически значимых различий выявлено не было. Выводы. Состав микробиоты желудка существенно отличается в зависимости от наличия или отсутствия инфекции Н. pylori. Наличие Н. pylori сопровождается снижением видового разнообразия бактерий с преобладанием в составе желудочного микробиома Н. pylori.

Авторы:

Издание: Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии
Год издания: 2024
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2024.-N 2.-С.72-82. Библ. 27 назв.
Просмотров: 4