Антибиотикорезистентность клинических изолятов Klebsiella pneumoniae и Escherichia coli в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования

Аннотация:

Цель. Изучить распространенность устойчивости к антибиотикам и основные механизмы резистентности, включая продукцию карбапенемаз, у клинических изолятов и Klebsiella pneumoniae и Escherichia coli, выделенных в различных регионах России в рамках многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» в 2020-2021 rr., а также исследовать структуру популяции К. pneumoniae и роль «клонов высокого риска» в распространении антибиотикорезистентности. Материалы и методы. Были исследованы изоляты К. pneumoniae (n = 2503) и E. coli (n - 2055), выделенные от госпитализированных пациентов в 55 стационарах 29 городов России. Идентификация проводилась методом времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) ' ствительность к антибиотикам определяли методом последовательных разведений в бульоне или агаре (для ?oc-фомицина), результаты интерпретировали согласно критериям EUCAST v13. Продукцию карбапенемаз определяли фенотипически методом инактивации карбапенемов (CIM), наличие генов наиболее распространенных сериновых карбапенемаз (KPC, O?A-48) и металло-бета-лактамаз (VIM, IMP, NDM) - методом ПЦР в реальном времени. Генотипирование К. pneumoniae проводили с помощью методов SNP-типирования и мультилокусного секвенирования-типирования (MLST). Определение K- и О-серотипов, приобретенных генов резистентности и вирулентности, а также плазмид, несущих эти гены, проводили на основании данных полногеномного секвенирования выборочных изолятов (n = 215). Результаты. Устойчивость нозокомиальных/внебольничных изолятов К. pneumoniae составила: амоксициллин-клавуланат - 88,63/57,99%, пиперациллин-тазобактам - 82,92/45,49%, цефотаксим - 87,74/56,97%, цефтазидим - 84,76/53,07%, цефепим - 81,43/49,18%, азтреонам -1,63/53,28%, цефтазидим-авибактам - 30,88/9,22%, цефтолозан-тазобактам - 70,06/31,35%, эртапенем - 72,10/28,69%, меропенем - 49,60/15,16%, имипенем - 44,54/13,73%, гентамицин - 60,82/30,33%, амикацин - 42,06/17,21%, ципрофлоксацин - 85,10/49,39%; тримето-прим-сульфаметоксазол - 74,38/48,1 6%, колистин - 5,96/2,25%. Устойчивость нозокомиальных/ внебольничных изолятов E. coli составила: ампициллин - 84,93/67,67%, амоксициллин-клавуланат - 57,37/39,73%, пиперациллин-тазобактам - 19,48/8,70%, цефотаксим - 63,83/34,19%, цефтазидим - 45,32/20,34%, цефепим - 35,95/16,61%, азтреонам - 51,78/26,11%, цефтазидим-авибактам - 5,71/0,80%, цефтолозан-тазобактам - 11,95/2,22%, эртапенем - 8,18/1,42%, меропенем - 5,17/0,53%, имипенем - 4,95/0,36%, гентамицин - 24,54/13,68%, амикацин -5,49/1,42%, ципрофлоксацин - 54,14/32,50%, триметоприм-сульфаметоксазол - 52,21/38,54%, фосфомицин - 2,48/1,43%, колистин - 1,60/1,07%, тигециклин - 6,35/3,11%. Частота продукции карбапенемаз среди нозокомиальных изолятов К. pneumoniae составила 65,32% (ОХА-48 -40,75%, NDM - 30,28%, KPC - 8,74%, ОХА-48 + NDM - 10,62%, ОХА-48 + KPC - 2,98%, NDM + KPC - 0,45%, ОХА-48 + NDM + KPC - 0,20%). Более 70% нозокомиальных изолятов К. pneumoniae принадлежали всего к 7 основным генетическим линиям, известным как «международные клоны высокого риска»: CC395 - 37,40%, CC23 - 9,59%, CC307 - 8,64%, CC147 - 7,61%, CC15- 2,95%, CC258 - 2,92% и CCII - 2,41%. Внебольничная популяция К. pneumoniae характеризовалась значительно большим генетическим разнообразием (индекс разнообразия Симпсона: D = 0,919; 95% ДИ: 0,904 - 0,933) по сравнению с популяцией госпитальных штаммов (индекс разнообразия Симпсона: D = 0,815; 95% ДИ: 0,802 - 0,827). Штаммы «гипервирулентной» генетической линии К. pneumoniae CC23 встречались чаще при внебольничных инфекциях. Выводы. Крайне высокая частота резистентности к цефалоспоринам у К. pneumoniae (> 80%) и E. coli (> 60%), а также высокая частота сочетанной устойчивости к аминогликозидам и фторхи-нолонам исключают возможность их эмпирического применения для лечения серьезных нозокомиальных инфекций, вызванных данной группой бактерий. У К. pneumoniae отмечается быстрое нарастание устойчивости к карбапенемам, в основном за счет распространения карбапенемаз трех основных групп: ОХА-48, NDM и KPC. Одновременно с ростом частоты продукции карбапенемаз следует отметить увеличение их разнообразия и доли штаммов, несущих гены NDM и KPC карбапенемаз, а также штаммов, несущих гены нескольких карбапенемаз одновременно. При внебольничных инфекциях основной клинически значимой проблемой является сохраняющаяся высокая частота устойчивости к цефалоспоринам у наиболее частого возбудителя - E. coli (> 30%), а также у К. pneumoniae (> 50%).

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2024
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2024.-N 1.-С.67-78. Библ. 24 назв.
Просмотров: 4