Сравнительный анализ структуры регуляторных генов штаммов Vibrio cholerae 01 биовара El Tor

Аннотация:

Экспрессия генов ctxAB и tcpA-F, кодирующих основные факторы патогенности возбудителя холеры, контролируется регуляторными генами, структура которых в штаммах возбудителя, выделенных в разные годы текущей пандемии, изучена не в полной мере. Цель работы — сравнительный анализ структуры регуляторных генов в штаммах Vibrio cholerae О1 биовара El Тог, изолированных на территории России и сопредельных стран на протяжении 7-й пандемии холеры. Материалы и методы. Использовали нуклеотидные последовательности полных геномов 29 токсигенных штаммов, выделенных с 1970 по 2023 г. Анализ проводили с помощью программ «BioEdit V7.2.6.1» и «Blast». Результаты. Проведён анализ 10 регуляторных генов (toxT, aphA, aphB, hns, hapR, vieA, luxO, IuxT, carS, carR). Установлено, что практически у всех штаммов в гене hapR имеется вставка тимина в позиции 219. Исключение составил V. cholerae М3208 (Тамбов, 2023), у которого обнаружена вставка 5 нуклеотидов в данном гене. У 44,8% изученных штаммов выявлены мутации в гене IuхО, функциональное значение которых не установлено. У 46,7 и 33,3% изученных геновариантов с аллелем ctxB1 обнаружены несинонимичные замены в генах hns (G319A) и vieA (С235Т) соответственно. Все геноварианты с аллелем ctxB7 имеют гены hns и vieA с мутациями. Три геноварианта с аллелем ctxB7, завезённые в Россию в последние годы, содержат изменённую структуру гена carR (G265A). Заключение. Структура генов (toxT, aphA, aphB, carS, luxT, hapR) является интактной у большинства изученных штаммов V. cholerae О1 El Тоr. В то же время выявлена вариабельность генов hns (G319A), vieA (С235Т) и carR (G256A). Мутации в данных генах могут быть использованы в качестве генетических меток современных геновариантов V. cholerae О1 El Тог.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2024
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2024.-N 4.-С.520-529. Библ. 28 назв.
Просмотров: 3