Современное представление о таксономии и классификации представителей порядка Legionellales (Legionellaceae, Coxiellaceae) отдела Pseuclomonadota

Аннотация:

C развития микробиологии, как науки, идентификация, систематика и классификация микроорганизмов осуществлялись на основании изучения фенотипических характеристик. Bo второй половине XX в. после открытия структуры ДНК и полимеразной цепной реакции в микробиологии наступила эра молекулярно-биологических исследований. C 2002 г. применение комплекса молекулярно-биологических и филогенетических методов было рекомендовано в качестве руководящего подхода в классификации и таксономии прокариот, что привело к реклассификации в некоторых таксонах. Представление о таксономии Legionella pneumophila (порядок Legionellales, класс Gammaproteobacteria) было сформулировано после вспышки болезни легионеров (легионеллеза) в США в 1976 г. Описание возбудителя лихорадки Ky - Coxiella bumetii произошло на 40 лет раньше, но его классификация и таксономический статус в порядке Rickettsiales (класс Alphaproteobacteria) были представлены некорректно на основании изучения доступных фенотипических характеристик в 1930-1950-е гг. Это на полвека определило «судьбу» С. burnetii и лихорадки Ку, включенных в список риккетсий и риккетсиозов, традиционно изучаемых риккетсиологами. B результате применения молекулярно-биологических методов в 1990-е гг. порядок Legionellales пополнился за счет нескольких представителей порядка Rickettsiales, три представителя которого (С. burnetii, Rickettsiella grilli и Wolbachia persica] были перемещены в класс Gammaproteobacteria. Анализ последовательности гена 16S pPHK привел к реклассификации Coxiella в отдельный род гамма-протеобактерий отдела Proteobacteria (сейчас Pseudomonadota) вместе с родами Legionella, Francisella и Rickettsiella, с представителями которых имеет наибольшее филогенетическое родство. Секвенирование гена 1 6S pPHK изолятов С. burnetii из разных географических регионов выявило только три замены оснований, указывая на то, что нуклеотидные последовательности этих штаммов являются близкородственными (степень гомологии - 99%), что подтверждает филогенетическую однородность рода Coxiella в рамках одного вида. Сравнительный анализ протеома представителей порядка Legionellales и филодендрограмма, построенная при изучении основных белков представителей родов Legionella, Coxiella, Acquicella и Rickettsiella (DipIorickettsia), позволила сформировать различные клады, подтверждающие их монофилию. Геном С. burnetii кодирует 24 аналогичных компонента из 27 задействованных в патогенезе L. pne?mophila по IVB типу секреторной системы (type IVB secretion systems). Верификация таксономического положения С. burnetii - пример использования молекулярно-биологических методов для решения вопросов таксономии и классификации прокариот. Целесообразно применение комплексного подхода, основанного на применении «классических» методов бактериологии и новых молекулярно-биологических и филогенетических методов, что позволит получить объективное представление о микроорганизмах, ассоциированных с популяцией человека.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2024
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2024.-N 2.-С.161-170. Библ. 51 назв.
Просмотров: 1