РНК-РЕДАКТИРОВАНИЕ АДЕНОЗИНДЕЗАМИНАЗАМИ ADAR В КЛЕТОЧНЫХ МОДЕЛЯХ БОЛЕЗНЕЙ ЭКСПАНСИИ CAG-ПОВТОРОВ: ЗНАЧИМЫЙ ЭФФЕКТ ДИФФЕРЕНЦИРОВКИ ИЗ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК В ОРГАНОИДЫ МОЗГА ПРИ ОТСУТСТВИИ СУЩЕСТВЕННОГО ВЛИЯНИЯ ЧИСЛА ПОВТОРОВ НА УРОВЕНЬ РЕДАКТИРОВАНИЯ

Аннотация:

Экспансия CAG-повторов в некоторых генах представляет собой установленную причину нескольких нейродегенеративных заболеваний, механизм патогенеза которых при этом остается неясным. Предполагается, что двухцепочечные регионы РНК, формируемые CAG-повторами, имеют токсические для клетки свойства. В работе проверяется гипотеза, согласно которой такие регионы РНК гипотетически могут отвлекать на себя ферменты редактирования РНК ADAR, тем самым снижая А—I редактирование РНК в клетке, что приводит к активации интерферонового ответа. Исследовали индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК), полученные из фибробластов пациентов, страдающих болезнью Гентингтона или атаксией типа 17, и дифференцированные из них органоиды среднего мозга. Для оценки редактирования в выбранных участках РНК разработали таргетную панель для секвенирования нового поколения. Дифференцировка ИПСК в органоиды мозга сопровождалась повышением экспрессии гена, кодирующего ADAR2, при снижении экспрессии белков-ингибиторов редактирования РНК. Как следствие, отмечали рост редактирования соответствующих субстратов ADAR2, тем самым имея возможность идентифицировать дифференциальные субстраты изоформ ADAR. При этом на уровне ИПСК сравнение групп патологии и контроля не выявило различий по уровню редактирования. В органоидах мозга, содержащих 42-46 CAG-повторов, также не наблюдали глобальных изменений. Однако органоиды мозга в образце, характеризуемом наибольшим количеством CAG-повторов в гене гентингтина (76), выделялись резким снижением уровня редактирования РНК отдельных транскриптов, в редактировании которых, предположительно, участвует ADAR1. В частности, в этом образце практически отсутствовало редактирование длинной некодирующей РНК PWAR5. В итоге показано, что в большинстве культур с экспансией повторов гипотеза о ее влиянии на редактирование РНК не подтвердилась.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2024
Объем: 18с.
Дополнительная информация: 2024.-N 8.-С.1412-1429. Библ. 74 назв.
Просмотров: 3