Опыт культивирования и молекулярно-генетическая характеристика полных геномов Mycoplasma pneumoniae, изолированных в России

Аннотация:

Цель. В 2023-2024 гг. в Москве был отмечен рост заболеваемости пневмонией, вызванной М. pneumoniae. Для изучения молекулярно-генетических особенностей патогена наибольшей информативностью обладают полногеномные последовательности. Однако, в настоящее время количество геномных данных М. pneumoniae крайне ограничено. Геномные данные актуальных для России изолятов до настоящего исследования в открытых источниках отсутствовали. Таким образом, целью исследования стало получение культур и полногеномных последовательностей изолятов М. pneumoniae, актуальных для России, их полная аннотация и изучение молекулярно-генетических характеристик. Используя клинический материал от пациентов с подтвержденной микоплазменной инфекцией, были получены культуры М. pneumoniae, для которых было проведено полногеномное секвенирование с последующей сборкой и аннотацией генома патогена. В результате мы получили три полные кольцевые последовательности генома М. pneumoniae, содержащие типичный набор генов и факторов вирулентности. Изоляты относились к сиквенс-типам ST3 и ST20 и содержали ранее неописанные мутации в белках цитоадгезии. С использованием всех доступных в открытых источниках геномных данных М. pneumoniae проведен филогенетический анализ, мультилокусное типирование, а также сравнительный анализ клинически значимых генов. Выводы. В этом исследовании мы охарактеризовали первые полногеномные последовательности М. pneumoniae, полученные на территории России, а также привели детальные методики культивирования патогена и процесса обработки данных, которые могут быть использованы для дальнейшего расширения объема доступных данных о генетической структуре патогена.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2024
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2024.-N 3.-С.275-285. Библ. 36 назв.
Просмотров: 4