Мутации в гене 23S рРНК, ассоциированные с устойчивостью к кларитромицину клинических изолятов Helicobacter pylori в Санкт-Петербурге

Аннотация:

Цель. Выявление точечных мутаций в гене 23S рРНК, ассоциированных с фенотипической лекарственной устойчивостью к кларитромицину (CLR) клинических изолятов Helicobacter pylori. Изучены 50 изолятов Н. pylori, выделенных от взрослых пациентов с хроническим гастритом (n = 36), язвенной болезнью 12-перстной кишки (n = 1 3) и раком желудка (n = 1) в период с 2014 по 2022 г. Из 50 изолятов 30 были получены от впервые выявленных больных, 20 - от ранее леченых. Культивирование Н. pylori осуществляли на обогащенном колумбийском агаре и инкубировали в микроаэрофильных условиях (GasPak 100). Чувствительность изолятов Н. pylori к кларитромицину определяли диско-диффузионным методом. Продукты амплификации гена 23S рРНК (1402 п. н.) секвенировали по Сэнгеру. Обработка хроматограмм, выравнивание сиквенсов на референсную последовательность Н. pylori 26695 и идентификация нуклеотидных замен выполнены с использованием программы Unipro UGENE v.38.1. В результате оценка результатов определения чувствительности 50 изолятов Н. pylori показала, что 30 изолятов являлись CLR-устойчивыми, 20 - CLR-чувствительными. Точечная мутация A2147G была обнаружена у 17 (56,7%) CLR-устойчивых изолятов и лишь у одного (5,0%) CLR-чувствительного изолята (р = 0,0002). Мутация A2146G выявлена у 13,3% (4/30) CLR-устойчивых изолятов (р = 0,14). Ни один из CLR-устойчивых изолятов не являлся носителем одновременно двух мутаций A2146G/A2147G, в то время как 9 (30,0%) не имели ни одной мутации. Таким образом, совпадение генотипической и фенотипической устойчивости к кларитромицину на основании присутствия мутаций A2146G + A2147G составило 70,0%. Все клинические изоляты, полученные от ранее леченых больных (n = 20), принадлежали к группе CLR-устойчивых. Из них 16 (80,0%) являлись носителями мутаций A2146G или A2147G, тогда как в группе впервые выявленных больных (n = 30) лишь 5 изолятов (16,7%) являлись носителями одной из двух мутаций (р = 0,003). Помимо точечных замен в позициях 2146/2147, нами были выявлены однонуклеотидные замены G1567T, С1568А/Т, A1825G, G1830A, Т1834С, Т2186С, однако без ассоциации с фенотипической лекарственной устойчивостью (р > 0,05). Выводы. Наше исследование показало, что из всех вариантов нуклеотидных замен в гене 235 рРНК, только одна (A2147G) ассоциирована с фенотипической лекарственной устойчивостью клинических изолятов Н. pylori к кларитромицину. Несмотря на низкую частоту встречаемости точечной мутации A2146G, детекция комбинированной мутации A2146G/A2147G может служить предиктором фенотипической устойчивости клинических изолятов Н. pylori.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2024
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2024.-N 3.-С.378-383. Библ. 20 назв.
Просмотров: 2