Применение секвенирования по Сэнгеру в этиологической диагностике бактериальных осложнений в стационаре

Аннотация:

Необходимость точной видовой идентификации микроорганизмов, вызывающих инфекционные осложнения у госпитализированных пациентов, в современном здравоохранении не вызывает сомнений. Цель. Определение возможности применения секвенирования по Сенгеру при рутинном микробиологическом обследовании пациентов в клинике внутренних болезней для повышения качества этиологической диагностики бактериальных осложнений. Исследовали клинические изоляты микроорганизмов, выделенных у пациентов многопрофильного медицинского центра. Применяли классические микробиологические методы посева и идентификации культур, секвенирование по Сэнгеру. Результаты. Идентификация по Сэнгеру с применением системы MicroSeq (Applied Biosystems, США) обеспечила идентификацию всех 231 исследованных изолятов бактерий — возбудителей нозокомиальных инфекций. Для дифференциальной диагностики стрептококков и коагулазонегативных стафилококков в некоторых случаях, когда известные последовательности первых 500 нуклеотидов гена 16S рРНК двух видов различались на 1-2 нуклеотида, повышение дискриминационного уровня видовой идентификации до 100% позволяло провести валидное определение видовой принадлежности изучаемого микроорганизма. Фенотипические методы не позволили выявить значительную часть видов (25,9%) возбудителей нозокомиальных инфекций и лишь 8 (13,8%) из них идентифицировали достоверно во всех случаях. Применение секвенирования по Сэнгеру для идентификации бактерий привело к долговременному эффекту, связанному с повышением квалификации врачей-лаборантов, улучшением дискриминационных возможностей визуальной оценки макроморфологии бактериальных культур, что важно для выявления всех видов микроорганизмов, присутствующих в биосубстратах. Заключение. Метод секвенирования по Сэнгеру является высокоэффективным и достаточно экономичным, по сравнению с широко применяемыми в клинической практике панелями биохимических тестов, методом «золотого стандарта» в этиологической диагностике бактериальных осложнений в клинике внутренних болезней.

Авторы:

Издание: Антибиотики и химиотерапия
Год издания: 2024
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2024.-N 9.-С.17-23. Библ. 43 назв.
Просмотров: 2