ГЕНЫ днРНК СЕМЕЙСТВА SNHG: КОМЕТИЛИРОВАНИЕ И ОБЩИЕ ФУНКЦИИ ПРИ РАКЕ ЯИЧНИКОВ

Аннотация:

Гены длинных некодирующих РНК (днРНК) семейства генов-хозяев малых ядрышковых РНК (SNHG) могут участвовать в онкогенезе как за счёт регуляторных функций, свойственных днРНК, так и за счёт влияния на образование малых ядрышковых РНК и биогенез рибосом. Цель данной работы - оценить в клинических образцах рака яичников (РЯ) изменения уровня метилирования и степень кометилирования группы генов днРНК семейства SNHG (SNHG1, GAS5/SNHG2, SNHG6, SNHG12, SNHG17) для разных стадий рака как критерии сходства их роли в онкогенезе. На представительной выборке 122 образцов РЯ методом количественной МС-ПЦР показано статистически значимое (р<{0,01-0,0001}) повышение уровня метилирования 5 исследуемых генов днРНК. Показана статистически значимая связь повышенного уровня метилирования GAS5, SNHG6, SNHG12 с прогрессией РЯ: с клинической стадией, размером опухоли и метастазированием, что указывает на возможную функциональную значимость гиперметилирования этих генов. Для 4 из 5 генов (SNHG1, GAS5, SNHG6, SNHG12) впервые выявлена статистически значимая попарная положительная корреляция уровней метилирования (rs> 0,35; р < 0,001). Полученные нами данные о кометилировании этих 4 генов находятся в согласии с данными GEPIA 2.0 (для 426 образцов РЯ), выявляющими их коэкспрессию (rs>0,5; р < 0,001); корреляция уровней экспрессии GAS5 и SNHG6 подтверждена количественной ОТ-ПЦР (rs = 0,46; р = 0,007). Для днРНК SNHG1, GASS, SNHG6 и SNHG12 биоинформатически предсказаны общие микроРНК, потенциально способные взаимодействовать с одной или несколькими из них по механизму конкурирующих эндогенных РНК. Предсказаны также мРНК, на экспрессию которых они, таким образом, способны влиять. Изучено возможное участие генов, соответствующих этим мРНК, в ряде значимых для онкогенеза процессов, включая процессинг и сплайсинг РНК и эпителиально-мезенхимальный переход. Таким образом, определены 4 днРНК семейства SNHG, имеющие сходство как в своей регуляции, так и в предполагаемых биологических функциях в патогенезе РЯ.

Авторы:

Издание: Биохимия
Год издания: 2024
Объем: 20с.
Дополнительная информация: 2024.-N 11.-С.1982-2001. Библ. 60 назв.
Просмотров: 1