Сравнительная характеристика фрагментов в белках вирусов гриппа A(HlNl)pdm09 и A(H3N2), мимикрирующих клеточные белки гемостаза человека

Аннотация:

Цель исследования: проанализировать сходство и отличия фрагментов, мимикрирующих клеточные белки системы гемостаза человека, в белках вирусов гриппа подтипов А(Н1 N1)pdm09 и A(H3N2). Проведен сравнительный биоинформационный анализ аминокислотной последовательности белков вирусов гриппа А/Санкт-Петербург/RII04/2016 (H1N1) pdm09 (выделенного в 2016 г.), A/Aichi/2/1968 (H3N2) (выделенного 1968г.), A/Port-Chalmers/1/1973/H3N2 (выделенного в 1973 г.) и А/New York/14545/2024 (H3N2) (выделенного в 2024 г.) и аминокислотной последовательности белков системы гемостаза человека (более 40 белков). Первичная структура анализируемых белков была взята из базы данных ncbi.nlm.nih.gov и nextprot.org. Аминокислотные последовательности, гомологичные в структуре вирусных и клеточных белков, детектировали по фрагментам длиной 12 аминокислот с идентичностью по >8 позициям. В результате сравнительный биоинформационный анализ аминокислотных последовательностей белков вирусов гриппа А подтипа А(Н1 N1 )pdm09 и A(H3N2) позволил выявить в составе ряда вирусных белков (РА, РВ2, NP, М1) целый ряд консервативных по месторасположению и по аминокислотной последовательности фрагментов, идентичных с клеточными белками системы гемостаза — факторами (F) свертывания крови (Fill, FVIII, FX, FXI, FXIII, фактор фон Виллебранда) и эндотелиальной синтазы оксида азота (endothelial nitric oxide synthase, eNOS). Эти данные дают основание предположить особую роль этих гомологичных фрагментов в жизненном цикле вирусов гриппа. В структуре белков вирусов A(H3N2) выявлены уникальные фрагменты, гомологичные к более чем 15 белкам системы гемостаза человека, которые не встречаются у вируса гриппа А(Н1 N1 )pdm09. Консервативность этих фрагментов по месторасположению и по аминокислотной последовательности сохраняется в белках вирусов гриппа A(H3N2) с 1973 г. и по настоящее время. По-видимому, появление данных гомологичных фрагментов и их закрепление в ходе эволюции вирусов дает определенные преимущества в репродукции вирусов гриппа A(H3N2). Заключение. В структуре белков вирусов A(H3N2) выявлены уникальные фрагменты, гомологичные к более чем 15 белкам системы гемостаза человека, которые не встречаются у вируса гриппа А(Н1 N1)pdm09.

Авторы:

Издание: Тромбоз гемостаз и реология
Год издания: 2025
Объем: 16с.
Дополнительная информация: 2025.-N 1.-С.57-72. Библ. 16 назв.
Просмотров: 3