СИНТЕЗ И СВОЙСТВА ФОСФОРИЛГУАНИДИНОВЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, СОДЕРЖАЩИХ 2,4-ЗАМКНУТЫЕ НУКЛЕОТИДНЫЕ ЗВЕНЬЯ

Аннотация:

Представлен новый вариант синтетических аналогов олигонуклеотидов, содержащих одновременно два типа модификаций - фосфорилгуанидиновую (PG) межнуклеотидную группу и 2',4'-замкнутые фрагменты рибозы (LNA) - в составе одного нуклеотидного звена. Показано, что при наличии PG-LN А-звеньев снижается электрофоретическая подвижность олигонуклеотидов, что прежде всего связано с электронейтральностью PG-группы. Также PG-LNA-модификации увеличивают гидрофобность олигонуклеотидов, вследствие чего они характеризуются большим временем удерживания при обращенно-фазовой хроматографии. Исследована термическая стабильность комплементарных дуплексов, содержащих PG-LNA-олигонуклеотиды. Показано, что температура плавления возрастает на 1.5-4.0°С на модификацию в зависимости от расположения модифицированного звена и ионной силы раствора. При этом методом спектрополяриметрии кругового дихроизма установлено, что пространственная структура комплексов, образованных PG-LNA, отличается от В-формы, что может быть обусловлено наличием LNA-фрагментов, имеющих З’-эндо-конформацию рибозного кольца. Таким образом, PG-LNA-олигонуклеотиды можно рассматривать как новый частично незаряженный структурный аналог РНК. Основываясь на полученных данных, можно заключить, что PG-LNA-олигонуклеотиды могут быть перспективным инструментом для различных методов выделения и анализа нуклеиновых кислот. Ключевые слова: модифицированные олигонуклеотиды, замкнутые нуклеиновые кислоты (LNA), фосфорилгуанидиновые (PG) олигонуклеотиды, температура плавления модифицированных дуплексов

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2025
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2025.-N 2.-С.318-328. Библ. 23 назв.
Просмотров: 1