Молекулярно-биологическая характеристика изолятов Streptococcus pneumoniae, выделенных от больных пневмококковым менингитом

Аннотация:

Цель работы — дать ключевые характеристики изолятов Streptococcus pneumoniae, циркулирующих на территории России в 2015-2020 гг. и выделенных от больных пневмококковым менингитом, на основании данных высокопроизводительного секвенирования, включая глобальные кластеры пневмококковых последовательностей, серотипы, факторы вирулентности и генетические детерминанты резистентности, в сравнении с клиническими данными по чувствительности к антимикробным препаратам (АМП). Исследовано 68 инвазивных изолятов S. pneumoniae, выделенных из крови и ликвора пациентов с бактериальным менингитом в разных регионах России в 2015-2020 гг. Видовую идентификацию проводили с учётом морфологии колоний на кровяном агаре, наличия а-гемолиза, отрицательной каталазной реакции, чувствительности к оптохину, положительных результатов латекс-агглютинации. Чувствительность изолятов к АМП определяли методом микроразведений в бульоне, категории чувствительности — на основании пограничных значений минимальных подавляющих концентраций (МПК). Проводили полногеномное секвенирование изолятов S. pneumoniae, анализ изолятов на сигнатуру пени-циллинсвязывающих белков, определение глобальных кластеров пневмококковых последовательностей, аллелей MLST, серотипов, сиквенс-типов и генов приобретённой резистентности (mefA, ermB, tetM, folA/P, cat), идентифицировали гены вирулентности. В результате выявлены 28 GPSC, 45 сиквенс-типов и 27 серотипов. Степень охвата ППВ-23 и ПКВ-13 составила 78 и 59% соответственно. Доминировали серотипы 3 (18%), 19F (9%), 23F (7%) и 15В (6%). Преобладала (43%) линия GPSC12 (серотип 3). Линии, экспрессирующие вакцинные серотипы GPSC1(19F), GPSC6(14), GPSC13(6A), GPSC904(14) и GPSC10(19F), обладали множественной антимикробной резистентностью, включая резистентность к пенициллину. Резистентные линии, экспрессирующие невакцинные серотипы, — GPSC230 (13) и GPSC177 (35F). В большинстве случаев установлено соответствие генотипической и фенотипической резистентности к пенициллину (повышенные МПК бета-лактамов коррелировали с типами пенициллинсвязывающих белков), эритромицину (ermB, mefA, ermB/mefA), клиндамицину 1 (ermB) и тетрациклину (tetM) и триметоприму-сульфаметоксазолу (folA, folP). У всех изолятов обнаружены гены вирулентности cbpG, lytA, pce/cbpE, pavA, pfbA, ply, hysA, nanA и cps4A. Цинковая металлопротеиназа С обнаружена у 13% изолятов. Заключение. Выявлено высокое разнообразие серотипов и линий среди изолятов пневмококков, выделенных у больных менингитом. Из 68 изолятов S. pneumoniae, выделенных у пациентов с бактериальным менингитом, более 17% относились к невакцинным серотипам. Результаты сопоставления фенотипической и генотипической антимикробной резистентности характеризовались хорошей конкордантностью, что указывает на необходимость дальнейшего изучения возможности использования полногеномного секвенирования в качестве диагностического инструмента для выявления механизмов резистентности у клинических изолятов пневмококков.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2025
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2025.-N 2.-С.150-161. Библ. 49 назв.
Просмотров: 0