Случаи развития повторной перипротезной инфекции Staphylococcus aureus: реинфекция или реактивация патогена?

Аннотация:

Актуальность. Staphylococcus aureus — один из наиболее частых возбудителей перипротезной инфекции (ППИ). Несмотря на высокое генетическое разнообразие штаммов S. aureus, определение филогенетических связей, а следовательно, и источника заражения является непростой задачей, которая может быть решена только при подробном сравнении геномов получаемых изолятов. Цель — используя полногеномное секвенирование с выявлением генетических и фенотипических отличий между изолятами, изучить возможность дифференцирования случаев заражения пациентов внутрибольничной перипротезной инфекцией с перспективой обоснованного выбора тактики лечения пациентов. Материал и методы. Были определены нуклеотидные последовательности геномов 20 изолятов S. aureus, полученных от 13 пациентов с перипротезной инфекцией. B работе были использованы стандартные микробиологические тесты и анализ геномов in silico программами ResFinder, KmerFinder, spaTyper и SCCmecFinder. Результаты. Применив филогенетический анализ с построением корового генома, были идентифицированы потенциальные случаи внутригоспитальной инфекции, а также исследованы случаи повторного развития инфекции. Показано родство изолятов, выделенных на протяжении 2012-2019 гг., а также эволюция их геномов с приобретением и потерей генов антибиотикорезистентности. Так, в одном из случаев повторного развития инфекции была обнаружена потеря нескольких генов за период ремиссии около S лет. При сравнении результатов фенотипического тестирования изолятов диско-диффузионным методом и предсказаний резистентности по данным анализа генома было выявлено несоответствие для трех изолятов, содержащих ген aac(6,)-aph(2") и резистентных к тобрамицину и гентамицину, но чувствительных к амикацину. Ha основании результатов лечения нескольких случаев с повторным развитием ППИ было выдвинуто предположение, что в случае развития инфекции, вызванной мультирезистентным внутригоспитальным штаммом, более эффективным может быть проведение радикального лечения. Заключение. Полногеномное секвенирование позволяет выявлять филогенетически родственные изоляты, общность генетических и фенотипических свойств которых подтверждает их родство. Ha фоне проводимой высокодозной антибактериальной терапии в геномах S. aureus накапливаются изменения, которые при молекулярногенетическом тестировании могут помочь обосновать выбор радикальной тактики лечения перипротезной инфекции — удаление эндопротеза. филогенетический анализ, коровый геном.

Авторы:

Издание: Травматология и ортопедия России
Год издания: 2025
Объем: 15с.
Дополнительная информация: 2025.-N 2.-С.18-32. Библ. 38 назв.
Просмотров: 0