СИКВЕНС-СПЕЦИФИЧНОСТЬ ДИМЕРНЫХ БИСБЕНЗИМИДАЗОЛОВ К АТ-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯМ ДНК РАЗЛИЧНОГО НУКЛЕОТИДНОГО СОСТАВА, ОПРЕДЕЛЕННАЯ С ПОМОЩЬЮ ФУТПРИНТИНГА

Аннотация:

Сайт-специфичность связывания с ДНК трех серий узкобороздочных лигандов - димерных бисбензимидазолов DB2(n), DB2P(n) и DB2Py(n) - впервые определена методом футпринтинга с ДНКазой I. Соединения состоят из двух бисбензимидазольных блоков, соединенных между собой олигометиленовыми линкерами различной длины (n). У DB2(n) и DВ2Р(n) общий мономер МВ2 представляет собой аналог Hoechst 33342, в котором удалено гидрофобное этоксифенильное ядро и на его место введена гидрофильная аминометиленовая группа. В состав структуры молекул серии DB2Py(n) входят два бензимидазольных кольца и одна пирролкарбоксамидная группа, являющаяся структурной единицей антибиотика нетропсина, специфичного к АТ-последовательностям ДНК. Показано, что все исследуемые соединения имеют специфичность в отношении АТ-пар нуклеотидов ДНК. Димерные бисбензимидазолы серии DB2P(n) и DB2(n) обладают повышенным сродством к последовательностям (ААТТ)3 и ТТТТ. Для DВ2Ру(n) определена высокая специфичность к АТ-богатым последовательностям и склонность первоочередно связываться с ТТТТ-мотивом. Все исследованные соединения не взаимодействуют с последовательностями, содержащими менее четырех АТ-пар оснований. Результаты демонстрируют потенциал этих соединений как инструментов для воздействия на определенные последовательности ДНК, что открывает перспективы их применению в молекулярной биологии и разработке лекарственных препаратов. Ключевые слова: сиквенс-специфичные узкобороздочные лиганды, бисбензимидазолы, футпринтинг, флуоресцентно-меченые фрагменты ДНК

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2025
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2025.-N 3.-С.408-417. Библ. 16 назв.
Просмотров: 0