ПОИСК ВОЗМОЖНЫХ САЙТОВ КОНЪЮГАЦИИ ЭЛЕКТРОФИЛОВ С БИОМОЛЕКУЛАМИ С ПОМОЩЬЮ МЕТОДОВ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

Аннотация:

Способность к быстрой реакции образования аддуктов с нуклеофильными группами белков, нуклеиновых кислот и липидов во многом определяет токсические эффекты электрофилов. С учетом того, что количество токсичных электрофилов практически не ограничено, а образовывать аддукты они могут со многими молекулярными мишенями, сугубо эмпирический подход к характеристике аддуктома заведомо непродуктивен. Цель настоящего исследования - разработать методику первичной in silico оценки вероятности конъюгации электрофилов с тем или иным сайтом модификации. Для модельной группы электрофилов с помощью метода теории функционала плотности были рассчитаны квантово-химические индексы, методом молекулярного докинга проведен поиск приоритетных сайтов ковалентного связывания исследуемых веществ. На основании полученных результатов была разработана шкала для оценки жесткости электрофилов и составлен алгоритм для компьютерного отбора возможных сайтов конъюгации электрофилов с биологическими макромолекулами.

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2025
Объем: 20с.
Дополнительная информация: 2025.-N 3.-С.496-515. Библ. 68 назв.
Просмотров: 1