Полногеномное секвенирование двух клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis с фенотипической чувствительностью к рифампицину при прогнозируемой Xpert MTB/RIF устойчивости

Аннотация:

Более 40% штаммов Mycobacterium tuberculosis устойчивы к рифампицину (RIF) и изониазиду — препаратам первого ряда. Возбудитель туберкулёза приобретает устойчивость к RIF главным образом за счёт мутаций в гене гроВ. Цель исследования — поиск наиболее вероятных компенсаторных мутаций в генах гроА, гроВ и гроС, кодирующих а-, В- и В'-субъединицы РНК-полимеразы М. tuberculosis. Материалы и методы. Перекрёстный анализ фенотипической и генетической устойчивости к RIF среди 2298 клинических штаммов М. tuberculosis выявил 8 случаев, когда устойчивость, определённая тестом Xpert Ultra MTB/RIF, не подтверждалась бактериологическим методом. Во всех случаях это были хронические больные туберкулёзом с множественной или широкой лекарственной устойчивостью, у которых был отменён RIF по причине обнаружения устойчивости к этому препарату у выделенного штамма. Для исследования генотипа, секвенирования по Сэнгеру и полногеномного секвенирования были получены 2 штамма. Результаты. Повторный тест Xpert Ultra MTB/RIF, секвенирование по Сэнгеру и полногеномное секвенирование выявили наличие единственной мутации S450L в гене гроВ при наличии фенотипической чувствительности у обоих штаммов. При филогенетическом анализе выяснено, что оба генома принадлежали к генотипу Beijing B0/W148. Штаммы отличались более высокой скоростью роста, чем другие изоляты. Выявлены две потенциальные компенсаторные мутации V483G и Н748Р в гене гроС при отсутствии других значимых изменений в генах гроА и гроВ. Заключение. Высказано предположение, что феномен расхождения бактериологических и молекулярно-генетических результатов связан с приобретением в процессе лечения RIF штаммами Beijing B0/W148 компенсаторных мутаций в гене гроС, а выявленные мутации влияют на конформацию В’-субъединицы, восстанавливая эффективность транскрипции, вызванную мажорной мутацией S450L.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2025
Объем: 7с.
Дополнительная информация: 2025.-N 3.-С.343-349. Библ. 12 назв.
Просмотров: 1