SNP ИДЕНТИФИКАЦИЯ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS МЕТОДОМ TaqMan ПЦР

Аннотация:

В рамках концепции ВОЗ о геномном эпидемиологическом надзоре разработана панель для ПЦР-идентификации основных эпидемических генотипов М. tuberculosis, циркулирующих на территории Северной Евразии. Апробация проведена на выборке из 590 случайно отобранных штаммов, циркулировавших в Красноярском крае и Иркутской области в 2021-2025 гг. Штаммов семейства генотипов Beijing (L2) было выявлено 308 и 164 соответственно. Идентифицированы генотипы: B0/W148 (197 и 76); Central Asian (85 и 47) и его подтип Central Asian Outbreak (12 и 25); неидентифицированных генотипов (orphans) — 14 и 16. Штаммов семейства генотипов Euro-American (L4) было выявлено 88 и 30 соответственно. Идентифицированы генотипы: Haarlem (9 и 6); LAM (35 и 7); Ural (19 и 5); S (2 и 0); неидентифицированных (orphans) генотипов — 15 и 12. Разработан подход, использующий две ПЦР для дискриминации основного массива штаммов семейства генотипов L2 и L4, охватывающих более 99 % всех штаммов возбудителя туберкулёза в России и других странах Северной Евразии. В рамках разработанного подхода необходимое и достаточное количество ПЦР для генотипирования и углублённого субтипирования штаммов не превышает восьми. Обсуждается целесообразность разработки тестов для дальнейшего субтипирования эпидемических генотипов.

Авторы:

Издание: Бюллетень экспериментальной биологии и медицины
Год издания: 2025
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2025.-N 10.-С.461-468. Библ. 16 назв.
Просмотров: 0