Идентификация значимых генов и сигнальных путей при бронхолегочной дисплазии у недоношенных новорожденных с помощью биоинформационного анализа

Аннотация:

Цель. Выявление потенциально значимых генов и ключевых путей, вовлеченных в патогенез бронхолегочной дисплазии у недоношенных новорожденных, с помощью биоинформационного анализа. Материалы и методы. Для биоинформационного анализа был использован набор данных GSE219156 из GEO. Идентификация дифференциально экспрессированных генов (DEG) осуществлена с применением веб-инструмента GEO2R. Функциональный анализ GO и KEGG выполнен посредством пакета ClusterProfiler. Анализ Reactome проведен с использованием платформы Enrichr. Визуализация полученных результатов реализована с помощью программного обеспечения SRplot. Сеть PPI для DEG построена с использованием веб-сайта STRING и визуализирована в Cytoscape. Для выявления генов-концентраторов был задействован плагин cytoHubba. Для сравнения групп были применены непараметрический критерий Манна-Уитни и t-тест. Результаты. Из 137 идентифицированных DEG 47 продемонстрировали пониженную экспрессию, 90 - повышенную. 10 DEG были идентифицированы как гены-концентраторы, в т.ч. CD27, IFNG, KLRK1, KLRD1, ТВХ21, EOMES, CXCR6 NCR1, CD 19 и CCL5. Среди них IFNG и KLRK1 были ключевыми участниками белок-белковых взаимодействий. При этом гуморальный адаптивный иммунитет показал значимость в качестве биологического процесса, в то врекря, как процессинг и презентация антигенов и цитотоксичность, опосредованная естественными клетками-киллерами, были определены в качестве ключевых сигнальных путей. Заключение. Результаты исследования указывают на то, что IFNG и KLRK1 могут рассматриваться как потенциально значимые гены в патогенезе бронхолегочной дисплазии.

Авторы:

Издание: Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии
Год издания: 2025
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2025.-N 4.-С.26-35. Библ. 28 назв.
Просмотров: 1