Биологическая и геномная характеристика фага Ес2-7 с антимикробной активностью против STEC-штаммов Escherichia coli

Аннотация:

Шигатоксин-продуцирующая бактерия Escherichia coli (STEC) является одной из ведущих причин бактериальных инфекций пищевого происхождения, а растущая антибиотикорезистентность этих штаммов требует поиска альтернативных методов борьбы. Цель исследования — охарактеризовать новый бактериофаг Ес2-7 с помощью биологических и молекулярно-генетических методов, провести филогенетический анализ и оценку его антимикробной активности in vitro в отношении STEC штамма. Биологическую и геномную характеристику бактериофага проводили с использованием общепринятых методов. Секвенирование ДНК выполняли на платформе Ion Proton, биоинформатический анализ осуществляли с применением инструментов RAST, VirulenceFinder, ResFinder, алгоритма BLAST и баз данных нуклеотидных последовательностей NCBI. Филогенетический анализ проводили с использованием платформ ViPTree и VIRIDIC. В результате бактериофаг Ес2-7, выделенный из сточных вод, формировал прозрачные бляшки диаметром 0,5—1 мм, обладал высокой скоростью адсорбции, коротким латентным периодом (20 мин), выходом 56+8 вирионов на клетку и устойчивостью к хлороформу. Он демонстрировал стабильность в агрессивных условиях и проявлял литическую активность в отношении STEC-штаммов. По данным полногеномного секвенирования, фаг Ес2-7 содержал двухцепочечную ДНК длиной 146 т.п.н. с содержанием С+С 38,9%. Филогенетический анализ протеома (ViPTree) позволил отнести фаг к группе Pseudomonadota, а сравнительный геномный анализ подтвердил его принадлежность к роду Phapecoctavirus. В геноме не обнаружено генов антибиотикорезистентности, вирулентности и токсинов. В экспериментах in vitro фаг Ес2-7 проявил антимикробную активность, снижая численность STEC на 99,7% в течение 6 ч после обработки. Заключение. Совокупность характеристик бактериофага Ес2-7 свидетельствовала о его потенциале для применения в фаготерапии и биоконтроле Е. coli.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2025
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2025.-N 3.-С.31-35. Библ. 18 назв.
Просмотров: 1