Ассоциация полиморфных вариантов гена TRIM22 (N155D и T242R) с ВИЧ-инфекцией в Северо-Западном федеральном округе России

Аннотация:

Введение. Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) остается глобальной проблемой здравоохранения. Ген TRIM22, кодирующий белок с противовирусной активностью, является перспективным кандидатом для исследований, однако его роль в патогенезе ВИЧ-инфекции в популяциях Российской Федерации ранее не изучалась. Целью работы был анализ полиморфных вариантов rs7935564 (N155D) и rs1063303 (7242R) гена TRIM22 у ВИЧ-инфицированных лиц в Северо-Западном федеральном округе. Материалы и методы. Проведён анализ полиморфных вариантов rs7935564 (N155D) и rs1063303 (T242R) гена TRIM22 в группах ВИЧ-инфицированных лиц с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии (л = 378) и практически здоровых лиц (л = 319). Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием. Статистический анализ включал проверку соответствия распределения генотипов равновесию Харди-Вайнберга, оценку ассоциаций по 3 моделям наследования (доминантной, рецессивной, аддитивной) с расчётом отношения шансов (ОШ) и 95% доверительного интервала (ДИ), анализ неравновесия сцепления и частот гаплотипов. Результаты. Распределение генотипов для анализируемых полиморфных вариантов соответствовало равновесию Харди-Вайнберга (p > 0,05). Выявлена достоверная ассоциация аллеля G полиморфизма rs7935564 с наличием ВИЧ-инфекции в рецессивной (ОШ = 1,76) и аддитивной (ОШ = 1,37) моделях наследования. Для полиморфизма rs1063303 значимая ассоциация наблюдалась только в доминантной модели (ОШ = 1,40). Обнаружено умеренное неравновесие сцепления между локусами (D, = 0,4478; r2 = 0,1572; p < 0,001). Гаплотип G-G (rs7935564_G — rs1063303_G) был ассоциирован с наличием инфекции (ОШ = 1,57). Заключение. B российской популяции полиморфный вариант rs7935564 (N155D) гена TRIM22 является значимым генетическим фактором ассоциации с ВИЧ-инфекцией, в то время какдля rs1063303 (T242R) получены статистически неоднозначные результаты. Ассоциация гаплотипа G-G с наличием инфекции свидетельствует о потенциальном синергетическом эффекте данных аллелей. Полученные данные подчёркивают важность учёта популяционной специфики при оценке генетических детерминант взаимодействия ВИЧ и организма-хозяина.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2025
Объем: 9с.
Дополнительная информация: 2025.-N 5.-С.530-538. Библ. 31 назв.
Просмотров: 0