Генетическое типирование ДНК-изолятов Coxiella burnetii, выделенных от больных лихорадкой Ку в Ставропольском крае

Аннотация:

Цель работы — генетическое типирование ДНК-изолятов Coxiella burnetii, выделенных на территории Ставропольского края (CК) в 2009-2023 гг., анализ генетической структуры популяции возбудителя лихорадки Ку в регионе. Материалы и методы. B работе использовали сыворотки крови от лихорадящих больных, полученные из Центра гигиены и эпидемиологии в Ставропольском крае в 2009-2023 гг. Проводили мультиспейсер-ное типирование (MST) С. burnetii, определяли принадлежность к MST-типу с помощью интернет-ресурса (http://ifr48.timone.univ-mrs.fr). Филогенетическое дерево строили в программе «MEGA». Плазмидное типирование осуществляли с использованием типоспецифичных праймеров к локусам плазмид QpH1, QpRS, QpDV, визуализацию полученных продуктов амплификации — путём проведения электрофореза в 2% агарозном геле. Территориальное распространение генетических вариантов анализировали с использованием программного обеспечения АгсGS10.1. Результаты. B ходе молекулярно-генетического типирования С. burnetii установлено, что на территории CК циркулируют штаммы возбудителя коксиеллёза, относящиеся к двум генотипам: MST7 и MST28 монофилетической группы I. Доминирующим генотипом на территории восточных районов CК является MST7, северных районов — MST28. Ha территории CК циркулирует возбудитель лихорадки Кy с единственным плазмидным типом — QpH1. Заключение. Определение плазмидного и MST-типа позволяет генотипировать ДНК изоляты С. burnetii без выделения чистой культуры, что может помочь при расследовании вспышек и формировании базы данных региональных ДНК изолятов.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2025
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2025.-N 5.-С.539-546. Библ. 26 назв.
Просмотров: 0