Метаанализ транскриптомных данных клеток меланомы B16 после воздействия дакарбазином in vivo

Аннотация:

Обоснование. Фенотипическая пластичность и гетерогенность клеток меланомы, обусловленные эпигенетической регуляцией и активностью транскрипционных факторов, играют ключевую роль в развитии резистентности к химиотерапии, что требует углублённого изучения молекулярных механизмов устойчивости к алкилирующим агентам, таким как да-карбазин. Цель исследования. Анализ транскриптомных данных клеток меланомы B16 после воздействия дакарбазином in vivo для выявления ключевых кластеров дифференциально экспрессирующихся генов и регулирующих транскрипционных факторов, ассоциированных с резистентностью к терапии. Методы. B исследовании использовали модель меланомы B16 у мышей C57B1/6, разделённых на контрольную и опытную (дакарбазин в дозе 50 мг/кг) группы по 12 особей. Тотальную PHK экстрагировали из опухолевой ткани, проводили высокопроизводительное секвенирование с последующей биоинформатической обработкой'для кластеризации генов и предсказания транскрипционных факторов — с использованием биоинформатических инструментов для анализа мотивов в последовательностях РНК. Результаты. C помощью NGS-секвенирования и биоинформатического анализа выявлено 670 дифференциально экспрессирующихся генов, объединённых в 12 функциональных кластеров, связанных с репарацией ДНК, апоптозом и клеточным циклом. Идентифицированы ключевые транскрипционные факторы (RELB, IRF5/7/4, NANOG, SOX2, LEFI, NFKB2), регулирующие сигнальные пути поддержания плюрипотентности ), ассоциированные с развитием устойчивости клеток меланомы B16 к алкилирующему агенту дакарбазину in vivo. Заключение. Выявлены эпигенетические и транскрипционные механизмы устойчивости клеток меланомы к воздействию химиотерапевтических средств, включая поддержание стволового фенотипа, регуляцию иммунного ответа и активацию эпителиально-мезенхимального перехода.

Авторы:

Издание: Казанский медицинский журнал
Год издания: 2025
Объем: 11с.
Дополнительная информация: 2025.-N 5.-С.776-786. Библ. 43 назв.
Просмотров: 0