ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ОРАНЖЕВО-КРАСНОГО ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО БИОМАРКЕРА DiB3-F53L

Аннотация:

Расчетным методом молекулярной динамики (МД) изучена пространственная организация флуоресцентного белка D1B3-F53L оранжево-красного флуоресцентного нековалентного комплекса генно-инженерного варианта бактериального белка липокалина В1с в комплексе с синтетическим GFP-подобным хромофором М739. Показано, что хромофор сильнее взаимодействует с мутированным белком DiB3-F53L по сравнению с нативным белком DiB3. Расчеты позволили установить аминокислотные остатки из окружения хромофора в сайте связывания, вносящие наибольший вклад в энергию взаимодействия хромофор-белок. Комплекс белка DiB3-F53L с хромофором М739 обладает повышенной яркостью флуоресценции по отношению к известному родительскому биомаркеру DiB3, что выдвигает его в число перспективных маркеров для мечения биологических объектов в клеточной биологии, а также в качестве стартового объекта для последующего дизайна новых более ярких биологических маркеров.

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2025
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2025.-N 6.-С.1088-1092. Библ. 12 назв.
Просмотров: 4