АНАЛИЗ БЕЛОК-БЕЛКОВОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ CREBBP, НТТ и KMT2D МЕТОДОМ ГЛАВНЫХ КОМПОНЕНТ

Аннотация:

Транскрипционный коактиватор CREBBP (cyclic AMP response element binding protein-binding protein), нейроспецифический регулятор транскрипции HTT (huntingtin) и гистон-лизиновая метилтрансфераза KMT2D (lysine methyltransferase 2D) кооперативно участвуют в посттрансляционной модификации гистонов и регуляции дифференциальной экспрессии генов. Механизм межбелкового взаимодействия исследован слабо. Компьютерный анализ первичной структуры белков методом главных компонент выявил наличие максимально высокой корреляции между главными компонентами аминокислотных последовательностей в парах CREBBP-НТТ и CREBBP KMT2D с глутамином. Траектория первой главной компоненты CREBBP практически совпадает с графиком позиционной частоты глутамина вдоль молекулы белка. Показано, что во вторичной структуре CREBBP существенную долю занимают элементы E-strand (extended strand) с открытой конформацией пептидной цепи. Полиглутаминовые тракты, локализованные на С-конце CREBBP, N-конце НТТ, N-, С-концах и в центре KMT2D также имеют открытую конформацию, облегчающую образование межмолекулярных водородных связей. Предполагается, что полиглутаминовые тракты С-конца CREBBP и N-конца НТТ непосредственно вовлечены в белок-белковый контакт CREBBP-НТТ. Аналогичная связь между полиглутаминовыми трактами С-конца CREBBP и центрального региона KMT2D фиксирует физическое взаимодействие в данной паре белков. Выявленные особенности исследованных белков могут быть использованы для конструирования новых фармакологических препаратов физико-химическими методами.

Авторы:

Издание: Биоорганическая химия
Год издания: 2025
Объем: 8с.
Дополнительная информация: 2025.-N 6.-С.1167-1174. Библ. 26 назв.
Просмотров: 1