Короткий катионный пептид с антибактериальной активностью, идентифицированный в протеоме Biautia producta

Аннотация:

Антибиотикорезистентность представляет собой одну из наиболее серьёзных угроз глобальному здравоохранению. Распространение устойчивых к антибиотикам бактерий приводит к росту числа неэффективных стандартных схем лечения инфекций и увеличению смертности среди пациентов. Согласно недавним оценкам, ежегодно миллионы случаев инфекций связаны с устойчивыми микроорганизмами, что существенно осложняет ведение пациентов и увеличивает экономическую нагрузку на систему здравоохранения. Данная проблема обусловливает необходимость поиска противомикробных соединений, однако количество новых одобренных методов лечения в последнее время остается ограниченным. В последние годы большой интерес вызывают антимикробные пептиды (АМП), которые продуцируются всеми живыми организмами. Известно, что АМП могут обладать выраженным антибактериальным, противовирусным, противогрибковым, противопаразитарным и противоопухолевым эффектами. Для de novo разработки новых АМП могут применяться различные подходы на основе искусственного интеллекта и машинного обучения, в которых аминокислотные последовательности кодируются как текстовые данные. Так, в своей работе Marcelo D. Т. Torres и соавт. показали, что пептиды могут быть идентифицированы в протеоме человека (так называемый метод «майнинга», или «добычи», пептидов»). В этих исследованиях авторы использовали простой скрипт на языке программирования Python, который дает возможность другим исследователям легко воспроизвести подобные эксперименты на других организмах. Мы предположили, что компоненты нормальной микробиоты человека могут содержать в себе зашифрованные последовательности коротких антибактериальных пептидов в своих протеомах. Целью данного исследования являлось использование метода «майнинга пептидов» для поиска новых коротких катионных пептидов в протеоме бактерии Blautia producta (компонента микробиома человека), а также исследование активности обнаруженных пептидов in vitro и vivo.

Авторы:

Издание: Медицинский вестник Северного Кавказа
Год издания: 2025
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2025.-N 4.-С.345-350. Библ. 30 назв.
Просмотров: 0