Жидкостная биопсия плазмы и цереброспинальной жидкости с выявлением внеклеточной опухолевой ДНК как инструмент для диагностики и генотипирования глиом: наблюдательное одномоментное пилотное исследование

Аннотация:

Жидкостная биопсия является перспективным методом анализа опухолевого генетического материала в плазме и цереброспинальной жидкости. Эти биологические среды характеризуются низкой концентрацией данного материала. Предполагается, что предварительная амплификация может повысить чувствительность анализа. Цель исследования. Оценить выявляемость и содержание внеклеточного опухолевого генетического материала в плазме и ликворе пациентов с глиомами с помощью цифровой капельной полимеразной цепной реакции без и с использованием преамплификации. В исследование включены образцы плазмы и цереброспинальной жидкости 25 пациентов с впервые установленной глиомой, которым была назначена операция по частичному или полному удалению опухоли. ДНК выделяли из 2,5-5 мл ликвора и 5 мл плазмы. Каждый образец анализировали с помощью цифровой капельной полимеразной цепной реакции на наличие мутаций генов IDH1 R132H и промотора TERT С228Т и С250Т. Поиск мутаций проводили как в растворе выделенной ДНК, так и в растворе после предварительной амплификации. Порог ложноположительных сигналов устанавливали в серии экспериментов с анализом образцов дикого типа и отрицательного контроля без матрицы. При статистической обработке для сравнения парных данных использовали критерии Манна-Уитни и Уилкоксона, для определения корреляционных связей — критерий Спирмена. В результате чувствительность и специфичность жидкостной биопсии ликвора без преамплификации составили 14,3 и 100% для пациентов с глиомами степени злокачественности 1-3 и 50 и 100% для пациентов с глиомами степени 4. После преамплификации данные значения составили 57,1 и 50% для глиом степени 1-3 и 75 и 80% для глиом степени 4. Отмечена значимая взаимосвязь между уровнями внеклеточной ДНК и объёмом, степенью злокачественности опухоли, а также характером её контрастного накопления (отсутствие, умеренное/неравномерное, интенсивное, кольцевидное). Заключение. Жидкостная биопсия с предварительной амплификацией ДНК обладает ограниченными чувствительностью и специфичностью в выявлении глиом, однако позволяет оценивать важные характеристики опухоли, что может быть полезно для выбора терапевтической тактики.

Авторы:

Издание: Казанский медицинский журнал
Год издания: 2025
Объем: 12с.
Дополнительная информация: 2025.-N 6.-С.909-920. Библ. 35 назв.
Просмотров: 0