Структура популяции Pseudomonas aeruginosa в Российской Федерации: роль клонов «высокого риска» в распространении карбапенемаз и устойчивости к карбапенемам

Аннотация:

Цель. Определить структуру популяции клинических штаммов Р. aeruginosa в стационарах различных регионов России и оценить роль клонов «высокого риска» в распространении карбапенемаз и резистентности к карбапенемам. В исследование включены последовательные, неповторяющиеся клинические изоляты Р. aeruginosa (N = 1379), полученные в 55 стационарах 30 городов России в течение 24 месяцев. Видовую идентификацию изолятов проводили методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Определение чувствительности к антибиотикам выполняли методом микроразведений в бульоне. Наличие генов приобретенных карбапенемаз групп VIM, IMP, NDM, GES-2/-5 определяли с помощью ПЦР в реальном времени. Субвидовое типирование изолятов и определение их принадлежности к известным сиквенс-типам и клональным комплексам проводили путем идентификации однонуклеотидных полиморфизмов в 7 хромосомных локусах, используемых в схеме мультилокусного секвенирования-типирования (MLST). Для выборочных изолятов, относящихся к основным клонам «высокого риска», выполнено полногеномное секвенирование (WGS) с последующей аннотацией генов резистентности. В результате все исследованные изоляты Р. aeruginosa были отнесены к 264 генетическим линиям, среди которых наибольшее распространение имели четыре клональных комплекса, относящихся к международным «клонам высокого риска»: СС235 (13,05%), СС244 (7,11%), СС654 (5,51%) и СС357 (4,21%). Три из этих линий - СС235, СС357 и СС654 - характеризовались значительно более высокими уровнями устойчивости к большинству антибиотиков, включая карбапенемы, и чаще ассоциировались с нозокомиальными, чем с внебольничными инфекциями. У 14,5% изолятов выявлена продукция карбапенемаз (VIM - 11,02%, GES-5 -2,61%, IMP - 0,44%, NDM - 0,44%), при этом большинство карбапенемазопродуцирующих штаммов принадлежали к клональным комплексам СС235 (52,0%) и СС654 (35,0%). Изоляты СС235, выделенные в различных регионах России, демонстрировали по данным WGS наибольшее разнообразие детерминант резистентности, включая гены карбапенемаз VIM-2, GES-5 и IMP-1. Напротив, все изоляты СС654 несли ген металло-бета-лактамазы VIM-2 и имели сходные генотипы и фенотипы устойчивости к антибиотикам разных классов. По сравнению с результатами предыдущих исследований в России отмечается тенденция к снижению доли СС235, включая карбапенемазопродуцирующие штаммы, при одновременном сохранении стабильной распространенности других клонов «высокого риска» в популяции Р. aeruginosa. Выводы. Несмотря на выявленное снижение частоты продукции карбапенемаз и уровня устойчивости к карбапенемам, полученные данные свидетельствуют о том, что штаммы, принадлежащие к клонам «высокого риска», остаются основными резервуарами и источниками распространения резистентности, что подчеркивает необходимость поддержания систематического молекулярного надзора и контроля за их циркуляцией.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2025
Объем: 10с.
Дополнительная информация: 2025.-N 4.-С.475-484. Библ. 22 назв.
Просмотров: 1