Генетическая характеристика изолятов Staphylococcus aureus, выделенных в реанимационном отделении инфекционного госпиталя в период пандемии COVID-19

Аннотация:

Цель. На основе результатов полногеномного секвенирования дать генетическую характеристику 5. aureus, выявленных в реанимационном отделении инфекционного госпиталя в период пандемии COVID-19. С помощью полногеномного секвенирования на платформе IIIumina MiSeq были получены 20 последовательностей S. aureus, изолированных от пациентов и с объектов внешней среды. Проведен биоинформационный анализ, включающий типирование, определение детерминант резистентности и вирулентности, плазмидных репликонов и филогенетический анализ. В результате выявлено значительное генетическое разнообразие S. aureus, включая четыре клональных комплекса (СС): СС15 - 6/20 (30%), СС8 - 3/20 (15%), СС22 - 2/20 (10%) и СС97 -2/20 (10%), 7/20 (35%) изолятов имели неопределенный СС. Изоляты СС8 и СС22 обнаружены только на средствах индивидуальной защиты (СИЗ) персонала, что указывает на роль СИЗ в передаче внутрибольничной инфекции. Филогенетический анализ показал кластеризацию со штаммами из разнообразных регионов. Выявлены гены резистентности к 9 классам антибиотиков, включая бета-лактамы (blaZ, mесА), тетрациклины (tet(38)) и фосфомицины (fosB). Гены вирулентности (токсины, супрессирующие иммунитет, экзоферменты) были обнаружены с высокой частотой (> 90%). Плазмидные репликоны (например, rер16, rер5а) были выявлены у 17/20 (85%) изолятов, что указывает на потенциал горизонтального переноса генов резистентности. Выводы. Полученные данные свидетельствуют о сложной внутрибольничной экосистеме S. aureus в реанимационном отделении инфекционного госпиталя, характеризующейся значительным генетическим разнообразием, высокой частотой детерминант антимикробной резистентности и вирулентности, выраженным плазмидным пулом. Доминирование изолятов, выделенных с СИЗ персонала, подчеркивает необходимость усиления мер инфекционного контроля для предотвращения распространения потенциально патогенных и полирезистентных штаммов S. aureus в условиях стационара.

Авторы:

Издание: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия
Год издания: 2025
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2025.-N 4.-С.524-536. Библ. 33 назв.
Просмотров: 1