Генетические особенности штаммов Vibrio Cholerae неО1/неО139 и Vibrio paracholerae, циркулирующих в реке Волге в районе Саратова

Аннотация:

Актуальность. Актуальность работы определяется критической необходимостью молекулярно-генетического мониторинга крупнейших речных систем для контроля распространения патогенных нетоксигенных вибрионов, включая недавно обнаруженный на территории России вид Vibrio paracholerae, на фоне усиления климатических и антропогенных рисков. Цель — изучение генетических особенностей штаммов V. Cholerae неО1/неО139 и V. paracholerae, выделенных из реки Волги в районе г. Саратова. Материалы и методы. Исследовали 21 штамм вибрионов, изолированных в 2024 г. Биохимические свойства изучали с применением набора api 20 E. Секвенирование проводили на платформе MGI DNBSEQ-G50. Для биоинформатического анализа применяли алгоритмы Blast v. 2.15.0, BioEdit v. 7.0.9.0. Филогенетическое древо на основе выравнивания коровых генов строили методом максимального правдоподобия с помощью iqtree v. 2.4.0. Результаты. При филогенетическом анализе 5 изучаемых изолятов вошли в один кластер с представителями V. paracholerae, что указывает на их отношение к данному виду. Штаммы V. Cholerae неО1/ неО139 и V. paracholerae не содержат профаги CTX? и RSI?, TLC-элемент, остров патогенности VPI-1, остров пандемичности VSP-I, а также ICE SXT-элемент. B то же время в их геноме выявлены гены to?R? toxS, ответственные за биосинтез регуляторных белков, контролирующих продукцию основных факторов патогенности; локусы системы секреции 6-го типа; токсина MARTX; маннозочувствительных пилей адгезии; белка внешней мембраны OmpW; гемолизина HIyA. У единичных штаммов обнаружены изменённые гены системы секреции 3-го типа; ген vc0496 из острова пандемичности VSP-II; система CRISPR-Cas 1-го класса; nanH острова патогенности VPI-2. При анализе специфических генов подтверждено отношение 5 выделенных штаммов к виду V. paracholerae. Заключение. B p. Волге в районе г. Саратова циркулируют не только штаммы V. cholerae неО1/неО139, но и штаммы V. paracholerae. Обе группы штаммов имеют сходные биохимические свойства и генетическое строение. B их геномах отсутствуют гены патогенности и ряд генов пандемичности, но выявлены локусы дополнительных токсинов, присутствие которых характерно для водных вибрионов. Необходимо дальнейшее сравнительное фенотипическое и молекулярно-генетическое изучение V. paracholerae.

Авторы:

Издание: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
Год издания: 2026
Объем: 14с.
Дополнительная информация: 2026.-N 1.-С.44-57. Библ. 32 назв.
Просмотров: 3