ХАРАКТЕРИСТИКА ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА СЕВЕРО-ЗАПАДЕ РОССИИ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СПОЛИГОТИПИРОВАНИЯ

Аннотация:

В настоящее время для дифференцировки штаммов Mycobacterium tuberculosis используют стандартизованный метод генотипирования IS6110-RFLP, который основан на выявлении геномного полиморфизма, обусловленного мобильным генетическим элементом IS6110. Однако данный метод имеет существенные ограничения, связанные с трудоемкостью исследования, использованием сложного дорогостоящего оборудования и необходимостью получения большого количества микробной ДНК, что в свою очередь требует длительного культивирования. Этих недостатков лишен метод, основанный на выявлении у микобактерий полиморфизма DR локуса хромосомы, который содержит короткие прямые повторы (direct repeats) нуклеотидов размером 36 пар оснований, расположенные в определенной последовательности и разделенные вариабельными участками — спейсерами. Метод получил название "сполиготипирование" (spoligotyping, англ. — spacer oligotyping), поскольку позволяет выявить у штаммов различия, обусловленные наличием или отсутствием отдельных спейсеров, посредством гибридизации амплифицированной in vitro ДНК с набором из 43 спейсерных олигонуклеотидов, фиксированных на мембране. Технически данный метод является более простым, не требует выделения больших количеств ДНК и, что особенно важно, позволяет проводить одновременную идентификацию и генотипирование не только культур, но и микробных клеток М. tuberculosis complex непосредственно в клиническом материале в течение 1—2 дней.

Авторы:

Издание: Проблемы туберкулеза
Год издания: 2002
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2002.-N 4.-С.44-48
Просмотров: 55