ХАРАКТЕРИСТИКА МОСКОВСКИХ ШТАММОВ HAEMOPHILUS INFLUENZAE ТИПА B МЕТОДОМ МУЛЬТИЛОКУСНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ-ТИПИРОВАНИЯ

Аннотация:

Генотип бактерий Haemophilus influenzae серотипа b (Hib) был охарактеризован методом мультилокусного секвенирования—типирования (МЛСТ) по 5 локусам (adk, fucK, mdh, pgi, recA). Изучены 42 московских штамма Hib (38 изолятов из спинномозговой жидкости детей, болевших гнойным менингитом в 1999—2001 гг., и 4 штамма от здоровых носителей Hib), a также 2 штамма Hib из Екатеринбурга. В МЛСТ штамм характеризуется аллелями и их комбинацией (аллельным профилем), называемым также сиквенс-типом (СТ). Среди российских бактерий Hib выявлено 9 СТ: у 25 (57%) штаммов обнаружен СТ1, у 8 (18%) - СТ-12, у 4 (9%) - СТ-11, у 2 (4,5%) - СТ-15, остальные СТ (13, 14, 16, 17, 51) встречаются в единичных случаях (2,3%). Анализ, основанный на сравнении аллельных профилей и самих нуклеотидных последовательностей, показал, что 93% российских изолятов, а именно штаммы с СТ 1, 11, 12, 13, 15, 17, принадлежат к одному клональному комплексу. Из изученных к настоящему времени 7 зарубежных штаммов Hib 2 изолята из Норвегии и Швеции можно отнести к этому же клональному комплексу, остальные 5 штаммов значительно отличаются от российских.

Авторы:

Издание: Молекулярная генетика ,микробиология и вирусология
Год издания: 2003
Объем: 5с.
Дополнительная информация: 2003.-N 2.-С.21-25
Просмотров: 43