ВОПРОСЫ ПРИМЕНЕНИЯ МЕТОДОВ АНАЛИЗА ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПРИ ИЗУЧЕНИИ ПРОЦЕССОВ СТАРЕНИЯ

Аннотация:

Процессы старения в настоящее время активно изучаются на основе анализа изменений в экспрессии генов со временем. Такие стандартные методы обработки числовых данных, как иерархическая кластеризация, метод К-средних, SOM (Self-organizing maps), Gene Shaving и др., не учитывают специфику временных изменений уровней экспрессии. В настоящей работе предлагаются новые подходы к анализу данных и методы кластеризации генов, основанные на исследовании приращений экспрессии генов со временем. Выделяются группы генов, имеющих согласованное поведение приращений уровней экспрессии в процессе старения организма с определяемым экспериментатором «пилотным» геном. Аналогичные методы используются при выделении кластеров, не связанных с «пилотным» геном, но имеющих высокую степень согласования поведения приращений экспрессии со временем во всех парах генов в кластере. В работе также анализируются специфические требования к достоверности данных в экспериментах по экспрессии.

Авторы:

Издание: Успехи геронтологии
Год издания: 2003
Объем: 13с.
Дополнительная информация: 2003.-N 11.-С.54-66
Просмотров: 27