СТАТИСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ АМИНОКИСЛОТНОГО КОДА ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА (СТАТЬЯ НА АНГ. ЯЗ.)

Аннотация:

Представлена статистическая модель аминокислотного кода вторичной структуры белка, описанного в предыдущей статье. Модель основана на структурных данных 2258 белков (использовано 417112 остатков аминокислот). Совпадение вычисленной по модели и экспериментальной вторичной структуры для обучающей выборки и тестовой выборки (104 белковые цепи, использовано 21 166 остатков аминокислот) почти одинаково и составляет 60 и 61 % соответственно, что равно пороговому значению для моделей, где, как и здесь, учитываются только ближайшие и средние по дальности взаимодействия. Как следствие, модель может быть использована для вычисления вторичной структуры белка, особенно в случаях, когда используются дополнительная информация и экспертный анализ, что характерно для наиболее успешных методов предсказания. Модель также может быть использована для анализа изменений вторичной структуры в процессе сворачивания белковой цепи и для моделирования образования супсрвторичной структуры.

Авторы:

Издание: Цитология
Год издания: 2003
Объем: 6с.
Дополнительная информация: 2003.-N 7.-С.707-712
Просмотров: 17